《科學(xué)通報》曾獲中科雙高期刊，第二屆全國優(yōu)秀科技期刊，第三屆（2005）國家期刊獎獲獎期刊，連續(xù)14屆獲得“百種中國杰出學(xué)術(shù)期刊”稱號，連續(xù)3屆獲中國出版政府獎期刊獎，2013年和2015年連續(xù)2屆獲“中國百強(qiáng)報刊”稱號。