2002年11月8日， 《分子植物育種》由國家科技部批準，國家新聞出版署核準。

　　2003年正式創刊，是由海南省科學技術協會主管，海南省生物工程協會主辦，公開發行的雙月刊科學期刊。

　　2015年正式改為月刊，每月28日公開發行。

　　2018年正式改為半月刊，每月14日和28日公開發行。

　　2019年，方宣鈞博士任本刊主編。

　　《分子植物育種》(ISSN1672-416X，CN46-1068/S)是由國家科技部批準，國家新聞出版署核準的刊物，由海南省科學技術協會主管，海南省生物工程協會主辦，公開發行的半月刊科學期刊。《分子植物育種》由海南省熱帶農業資源研究所所長方宣鈞博士任主編，北京大學朱玉賢院士和福建農林大學吳為人博士任執行主編。

　　她“立足國內，面向國際”，是一份為轉基因育種、分子標記輔助育種及常規育種服務的國際化科學雜志。圍繞水稻、小麥、玉米、油菜、大豆、棉麻、薯類、果樹、蔬菜、花卉、茶葉、林業和草木等，刊登分子遺傳育種理論、分子育種方法、分子育種研究動態以及優良種質培育等方面的科學論文報道。本刊按國際標準編排，題目摘要、圖表和引用文獻等均實行中英文對照。